毒理：苍耳过量服用容易中毒，据初步研究，多数学者认为这与其含毒性蛋白有关，也有部分学者认为毒性物质为苍耳甙和生物碱。毒蛋白是一种细胞原浆毒，其毒性可影响到机体的各个系统，常损害肝、心、肾等内脏实质细胞，使之发生混浊、肿胀、坏死，并使毛细血管扩张，血管渗透性增加，引起广泛性出血。中毒者常因呼吸及循环衰竭而死亡，同时出现消化及神经系统功能障碍，尤以肝脏损害为甚，有的还因出现肝昏迷而迅速死亡，即使治愈，也易留下肝脾肿大的后遗症。通过加热，能破坏毒蛋白的毒性。
毒性：苍耳全株均有毒，苍耳子仁脱脂部分的水浸剂毒性很大。若苍耳子用量过大(30克以上)或误食苍耳子10枚以上，可致中毒。金传山等按0.2毫升/10克剂量给小鼠灌肠，每组10只，观察24小时内小鼠死亡数量。结果生品致小鼠死亡8只，炒品3只，炒后去刺则无死亡。其所作毒性实验结果证明苍耳子炒后去刺毒性最小，炒品次之，生品毒性最大。
中毒治疗：早期宜用催吐法，吐后即用牛奶或豆浆500毫升温服。服药超过4小时者，宜用芒硝口服以泻下排毒，并应暂停饮食数小时至一天，在此期间大量喝糖水，或银花甘草绿豆汤以解毒、养阴。严重者早期可洗胃、导泻及用2%生理盐水高位灌汤，配合高渗葡萄糖静脉注射。可注射维生素K预防出血，必要时考虑输血浆，有出血倾向者，可服中药双花、生地、丹皮、甘草、白茅根、小蓟等清热解毒，凉血止血。有肝脏损害者，可服枸橼酸胆碱、肌肉注射甲硫氨基酸并给低脂饮食。
